Az évek során az ékkő sok kézben megfordult, birtokolták gonosz szellemek, és még gonoszabb emberek. Mire visszakerül a szellemirtók falujába (InuYasha ébredése előtt 50 évvel), addigra oly mértékben beszennyeződik, hogy a szellemirtók már nem tudják kordában tartani. Kikyoura bízzák, aki szintén a szellemírók falujából származó, nagy szellemi erővel rendelkező papnő. Kikyou megrendíthetetlen erővel vigyáz az ékkőre, harcol a szellemekkel, gonosz lelkekkel.

Kikyou már egy ideje gondoz egy szerencsétlenül járt halandót, Onigumot. A férfi egész teste megégett, tagja töröttek, a beszéden kívül szinte semmire nem képes. Kikyou ápolja, eteti Onigumot, nem is sejtvén, hogy a férfi az idők során beleszeret. Onigumo végső elkeseredésében a szellemeknek ajánlja fel velejéig romlott lelkét, s cserébe csak annyit kér, hogy újra járhasson. Sok száz szellem szállja meg azon az éjszakán Onigumo testét, majd a halandó gonosz lelkével egyesülve megszületik Naraku.

Kikyou egy napon megismerkedik InuYashaval, akinek szintén a gyöngyre fáj a foga. Kikyou távol tartja a fiút az ékkőtől, de nem bántja, nem öli meg.

InuYasha ugyanis egy hanyou, vagyis félig ember félig szellem vérből való. Az ékkő segítségével akar teljes szellemmé változni. Egyre közelebb kerülnek egymáshoz, majd kibontakozó barátságuk reménytelen szerelemmé válik. InuYasha megígéri Kikyounak, hogy a Shikon no Tama segítségével nem szellemmé, hanem emberré változik.

Másnap délutánra találkát beszélnek meg a Szent fánál (Goshinboku), és a tervek szerint InuYasha át fog változni emberré. Este Kikyou InuYasha hangját hallja a fák közül, s a fiú arra kéri, találkozzanak inkább pirkadatkor. Kikyou mit sem sejtve beleegyezik, pedig Naraku áll a fák között, felvéve InuYasha alakját. Hajnalban Kikyou elviszi a Négy lélek gyöngyét a megbeszélt helyre, de Naraku InuYasha képében hátulról támadva halálos sebet ejt a papnőn. Naraku felveszi Kiyou alakját, és visszaviszi az ékkövet a papnő  falujába, majd InuYashahoz indul.

InuYasha a megbeszéltek szerint a Szent fánál vár Kikyoura, amikor nyílvessző fúródik mellette a fába. "Meghalsz InuYasha!" Hangzanak Naraku szavai. InuYasha a faluba indul, hogy ellopja az ékkövet. Itt lép be a történetbe az anime első része. InuYasha kezében az gyönggyel, a Szent fa felé száguld, amikor eltalálja a valós Kikyou bűvös nyila. A varázslat a Szent fához szegezi a hanyout, örök álomra kárhoztatva. Kikyou sebesülésétől szédelegve a földre zuhan, húga (Kaede) kezébe nyomja az ékkövet. A szerencsétlenül járt papnőt a Négy lélek gyöngyével együtt elhamvasztják.